Die Aufteilung der Einnahmen unter den beiden Teilländern und vor allem die Diskussion, wer höhere Mehrwertsteuern abführt, ist in der Förderation Bosnien-Herzegowina ist seit langem Gegenstand von Diskussionen. Nach Angaben der Steuerbehörde von Bosnien-Herzegowina wurde aus beiden Teilländern im Laufe eines Jahres fast der gleiche Betrag an Mehrwertssteuereinnahmen gemeldet. Im Jahr 2019 nahm das Teilland Föderation 2,56 Milliarden Konvertible Mark (circa 1,30 Milliarden Euro) an Mehrwertsteuern oder 64,3 Prozent des Gesamtbetrags ein. Der von der Republika Srpska gemeldete Betrag belief sich auf 1,3 Milliarden Konvertible Mark (etwa 66,2 Millionen Euro) oder 32,6 Prozent, während aus dem Distrikt Brčko, der dritten eigenständigen Verwaltungseinheit, 118 Millionen Konvertible Mark (circa 60 Millionen Euro) oder 2,97 Prozent eingezahlt wurden. Beim Vergleich aller Daten wird ersichtlich, dass dem Teilland Föderation 64,31 Prozent, der Republika Srpska 32,14 Prozent und dem Distrik Brčko 3,55 Prozent zugutekommen. Eine Gemeinsamkeit der beiden Teilländer ist die Unterstützung des Distrikts Brčko, dem ein Teil ihrer Mehrwertsteuereinnahmen zugesprochen wird.